SEAFDECINSTITUTIONAL REPOSITORY
    • English
    • ไทย
    • 日本語
    • Bahasa Indonesia
    • Bahasa Melayu
    • Burmese
    • Filipino
    • Khmer
    • Lao
    • Tiếng Việt
  • ไทย 
    • English
    • ไทย
    • 日本語
    • Bahasa Indonesia
    • Bahasa Melayu
    • Burmese
    • Filipino
    • Khmer
    • Lao
    • Tiếng Việt
  • เข้าสู่ระบบ
ดูรายการ 
  •   SIR บ้าน
  • 03 SEAFDEC External Publications
  • Journal Articles, Conference Papers and Book Chapters by SEAFDEC Staff
  • Journal Articles
  • AQD Journal Articles
  • ดูรายการ
  •   SIR บ้าน
  • 03 SEAFDEC External Publications
  • Journal Articles, Conference Papers and Book Chapters by SEAFDEC Staff
  • Journal Articles
  • AQD Journal Articles
  • ดูรายการ
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Characteristics of dehalogenase from bacteria isolated from the gut of pond-reared rohu (Labeo rohita) juveniles in Myanmar

Thumbnail
URL ที่เชื่อมโยง
www.scirp.org
วันที่
2012
ผู้เขียน
Abel, Eleanor
Pakingking, Rolando V., Jr.
Pagador, Gregoria
Wint, May Thanda
Huyop, Fahrul
Page views
150
เมตาดาต้า
แสดงระเบียนรายการเต็ม

Cited times in Scopus



Share 
 
นามธรรม
Unwarranted accumulation of halogenated compounds in the rivers and streams has in recent years emerged due to the widespread use agricultural pesticides. The presence of these halogenated compounds in the water does not only suppress the immune system of fish but adversely induce serious morbidity and mortality among cultured stocks. Importantly, gradual accumulation of these compounds in the system of cultured and wild freshwater fish species cultured in ponds and floating net-cages in dams and rivers, respectively, poses some risks to humans, the end users. In this study, we attempted to isolate bacteria from the gut of pond-reared rohu (Labeo rohita) in Myanmar, screened the isolated bacteria for dehalogenase gene using molecular technique and tested the ability of these bacteria to degrade halogenated compounds in vitro. The eight bacterial strains studied were identified as Enterobacter mori strain MK-121001, Enterobacter cloacae strains MK121003, MK-121004, MK121010, Ralstonia solanacearum strain 121002, Acinetobacter baumannii strain MK121007, Chromobacterium violaceum strain MK121009 and Pantoea vagans strain 121011. Only three bacterial strains (MK121002, MK121007 and MK121009) were capable of degrading 2,2-dichloropropionic acid (2,2-DCP) as the sole carbon source up to a final substrate concentration of 20 mM. Their mean growth doubling time ranging from 6 - 23 hours with the maximum of chloride ion released of 85%. PCR amplification with oligonucleotide primers designed from group I dehalogenase revealed the presence of dehalogenase genes in all isolates suggesting dehalogenase gene in strains 121001, 121003, 121004, 121010 and 121011 were silenced. In contrast, group II dehalogenase primers did not show any PCR amplification. These results suggest that MK121002, MK121007 and MK121009 only encode a group I dehalogenase and its non-stereoselectivity is in agreement with previoulsly described group I haloacid dehalogenase. The partial gene sequences were blasted but no significant sequence identity was observed. Therefore, it suggests the 2-haloacid dehalogenase of MK121002, MK12-1007 and MK- 121009 might be a novel group I 2-haloacid dehalogenase. The results indicated a broad distribution of dehalogenation genes in many microbial genomes that harbor dehalogenase(s) due to the exposure of the microorganisms to the naturally occurring or man-made halogenated compounds in the environmental systems. So far, microorganisms capable of producing dehalogenases were mainly isolated from soil and scarcely from aquatic animals and their environments. To the authors’ knowledge, this is the first report on the isolation of dehalogenase-producing bacteria from the gut of pond-reared freshwater fish, Labeo rohita, in Myanmar.
URI
http://hdl.handle.net/10862/2169
การอ้างอิง
Abel, E., Pakingking, R. V., Jr., Pagador, G., Wint, M. T., & Huyop, F. (2012). Characteristics of dehalogenase from bacteria isolated from the gut of pond-reared rohu (Labeo rohita) juveniles in Myanmar. Advances in Bioscience and Biotechnology, 3, 353-361. https://doi.org/10.4236/abb.2012.34051 
DOI
10.4236/abb.2012.34051
เรื่อง
biodegradation ASFA; 2,2-Dichloropropionic Acid; 16S rDNA; Labeo rohita AGROVOC; Dehalogenase gene; Haloalkanoic acid; Dichloropropionate
คอลเลกชัน
  • AQD Journal Articles [1196]

© SEAFDEC 2023
ติดต่อเรา
 

 

หมวด

ทั้งหมดของ SIRชุมชนและคอลเล็กชันตามวันที่ออกผู้เขียนชื่อเรื่องอาสาสมัครคอลเลกชันนี้ตามวันที่ออกผู้เขียนชื่อเรื่องอาสาสมัคร

บัญชีของฉัน

เข้าสู่ระบบRegister

Statistics

View Usage Statistics
Related Links
SEAFDEC/TD IRSEAFDEC/AQD IRSEAFDEC/MFRDMD IRSEAFDEC/IFRDMD IR

© SEAFDEC 2023
ติดต่อเรา
 

 

การปฏิเสธความรับผิดเกี่ยวกับลิงก์ภายนอก

ลิงค์นี้จัดทำขึ้นเพื่อความสะดวกและเพื่อให้ข้อมูลเท่านั้น SEAFDEC ไม่รับผิดชอบต่อความถูกต้อง ความถูกต้องตามกฎหมาย หรือเนื้อหาของเว็บไซต์ภายนอกหรือลิงก์ที่ตามมา ติดต่อไซต์ภายนอกสำหรับคำตอบสำหรับคำถามเกี่ยวกับเนื้อหา

หากคุณพบลิงก์ภายนอกที่ใช้งานไม่ได้ เราจะยินดีเป็นอย่างยิ่งหากคุณสามารถรายงานไปยัง ผู้ดูแลระบบพื้นที่เก็บข้อมูล.

คลิก ดาวน์โหลด เพื่อเปิด/ดูไฟล์

ดาวน์โหลด