SEAFDECINSTITUTIONAL REPOSITORY
    • English
    • ไทย
    • 日本語
    • Bahasa Indonesia
    • Bahasa Melayu
    • Burmese
    • Filipino
    • Khmer
    • Lao
    • Tiếng Việt
  • ไทย 
    • English
    • ไทย
    • 日本語
    • Bahasa Indonesia
    • Bahasa Melayu
    • Burmese
    • Filipino
    • Khmer
    • Lao
    • Tiếng Việt
  • เข้าสู่ระบบ
ดูรายการ 
  •   SIR บ้าน
  • 03 SEAFDEC External Publications
  • Journal Articles, Conference Papers and Book Chapters by SEAFDEC Staff
  • Conference Proceedings
  • AQD Conference Proceedings
  • ดูรายการ
  •   SIR บ้าน
  • 03 SEAFDEC External Publications
  • Journal Articles, Conference Papers and Book Chapters by SEAFDEC Staff
  • Conference Proceedings
  • AQD Conference Proceedings
  • ดูรายการ
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

DNA amplicons using arbitrary primers distinguish polymorphic loci among mangrove thraustochytrid genomes

Thumbnail
ดู/เปิด
วันที่
2007
ผู้เขียน
Oclarit, Jose M.
Hepowit, Nathaniel L.
Page views
398
เมตาดาต้า
แสดงระเบียนรายการเต็ม

Cited times in Scopus



Share 
 
นามธรรม
Thraustochytrids - lightly-pigmented estuarine and marine microheterotrophs, taxonomically aligned with heterokont algae - are of great biotechnological interest because they produce substantial amounts of polyunsaturated fatty acids (PUFAs) especially docosahexaenoic acid (DHA:6n3). In this study, twenty-seven strains, isolated from twenty mangrove areas in the Philippine archipelago, were mass-produced in axenic flask cultures using high-glucose medium with continuous agitation. Polymorphic loci of thraustochytrid genomes, determined using four arbitrary primers (OPC02, OPC05, OPC07 and OPC08) in PCR analysis, were randomly amplified as molecular markers for genetic fingerprinting. Electrophoretic banding patterns of DNA amplicons, recognized based on nucleic acid size, were scored on data matrix and analyzed using Jaccard's coefficient and single-linkage hierarchical clustering to characterize degree of genetic relatedness among thraustochytrids. Conclusively, nearest-neighbor dendrogram of randomly amplified polymorphic DNAs (RAPDs) markers classify the strains into two monophenetic clades, representing the two major genera: Schizochytrium and Thraustochytrium.
URI
http://hdl.handle.net/10862/2185
การอ้างอิง
Oclarit, J. M., & Hepowit, N. L. (2007). DNA amplicons using arbitrary primers distinguish polymorphic loci among mangrove thraustochytrid genomes. In OCEANS 2007 - Europe (pp. 1-7). Piscataway, NJ: Institute of Electrical and Electronics Engineers.
DOI
10.1109/OCEANSE.2007.4302194
เรื่อง
genomes ASFA; estuaries ASFA; DNA ASFA; brackishwater environment ASFA; mangroves ASFA; conferences ASFA; Oceans ASFA; primers ASFA; Algae ASFA; Europe
คอลเลกชัน
  • AQD Conference Proceedings [298]

© SEAFDEC 2025
ติดต่อเรา
 

 

หมวด

ทั้งหมดของ SIRชุมชนและคอลเล็กชันตามวันที่ออกผู้เขียนชื่อเรื่องอาสาสมัครคอลเลกชันนี้ตามวันที่ออกผู้เขียนชื่อเรื่องอาสาสมัคร

บัญชีของฉัน

เข้าสู่ระบบ

Statistics

View Usage Statistics
Related Links
SEAFDEC/TD IRSEAFDEC/AQD IRSEAFDEC/MFRDMD IRSEAFDEC/IFRDMD IR

© SEAFDEC 2025
ติดต่อเรา